The imperative for quality control programs in Monkeypox virus DNA testing by PCR: CIBERINFEC quality control
Por:
de Salazar A, Martínez MJ, Navero-Castillejos J, Negredo A, Galán JC, Rojo Molinero E, Lagarejos E, Munoz-Almagro C, Hernández Rodríguez Á, Lepe JA, Antón Pagarolas A, Pérez Castro S, Zamora Cintas MI, Domínguez-Gil González M, Niubó-Bosch J, Gutiérrez Arroyo A, Vazquez A, García F and Sánchez-Seco Fariñas MP
Publicada:
1 nov 2023
Resumen:
To evaluate molecular assays for Mpox diagnosis available in various clinical microbiology services in Spain through a quality control (QC) approach. A total of 14 centers from across Spain participated in the study. The Reference Laboratory dispatched eight serum samples and eight nucleic acid extracts to each participating center. Some samples were spiked with Mpox or Vaccinia virus to mimic positive samples for Mpox or other orthopox viruses. Participating centers provided information on the results obtained, as well as the laboratory methods used. Among the 14 participating centers seven different commercial assays were employed, with the most commonly used kit being LightMix Modular Orthopox/Monkeypox (Mpox) Virus (Roche((R))). Of the 12 centers conducting Mpox determinations, concordance ranged from 62.5% (n=1) to 100% (n=11) for eluates and from 75.0% (n=1) to 100% (n=10) for serum. Among the 10 centers performing Orthopoxvirus determinations, a 100% concordance was observed for eluates, while for serum, concordance ranged from 87.5% (n=6) to 100% (n=4). Repeatedly, 6 different centers reported a false negative in serum samples for Orthopoxvirus diagnosis, particularly in a sample with borderline C-t=39. Conversely, one center, using the TaqMan (TM) Mpox Virus Microbe Detection Assay (Thermo Fisher), reported false positives in Mpox diagnosis for samples spiked with vaccinia virus due to cross-reactions. We observed a positive correlation of various diagnostic assays for Mpox used by the participating centers with the reference values. Our results highlight the significance of standardization, validation, and ongoing QC in the microbiological diagnosis of infectious diseases, which might be particularly relevant for emerging viruses.
Filiaciones:
de Salazar A:
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario San Cecilio, Granada, Spain
Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs.Granada, Granada, Spain
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain
Martínez MJ:
Servicio de Microbiología, Hospital Clinic de Barcelona, Spain
Instituto de Salud Global de Barcelona (ISGloba), Barcelona, Spain
Navero-Castillejos J:
Servicio de Microbiología, Hospital Clinic de Barcelona, Spain
Negredo A:
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain
Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain
Galán JC:
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain
Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain
Rojo Molinero E:
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain
Departamento de Microbiología, Hospital Universitario Son Espases, Health Research Institute of Balearic Islands (IdISBa), Palma, Spain
Lagarejos E:
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario de Gran Canaria Dr. Negrín, Las Palmas de Gran Canaria, Spain
Munoz-Almagro C:
Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain
RDI Microbiology Department, Hospital Sant Joan de Deu, Barcelona, Spain
Departamento de Medicina, School of Medicine, Universitat Internacional de Catalunya, Barcelona, Spain
Hernández Rodríguez Á:
Laboratori Clínic de la Metropolitana Nord, Servei de Microbiologia, Hospital Universitari Germans Trias i Pujol, Badalona, Spain
Lepe JA:
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain
Unidad de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Parasitología, Hospital Universitario Virgen del Rocio, Sevilla, Spain
Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS), Sevilla, Spain
Antón Pagarolas A:
Departamento de Microbiología, Hospital Universitari Vall d'Hebron, PROSICS Barcelona, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain
Pérez Castro S:
Servicio Microbiología, Complexo Hospitalario Universitario de Vigo, Vigo, Spain
Zamora Cintas MI:
Servicio de Microbiología, Hospital Central de la Defensa "Gómez-Ulla", Madrid, Spain
Domínguez-Gil González M:
Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Río Hortega, Valladolid, Spain
Niubó-Bosch J:
Laboratori Clínic Territorial Metropolitana Sud, Departamento de Microbiología, Hospital Universitari de Bellvitge, Institut Català de la Salut (ICS), Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain
Bellvitge Biomedical Research Institute (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain
Gutiérrez Arroyo A:
Servicio de Microbiología Clínica, Hospital Universitario La Paz, Madrid, Spain
Vazquez A:
Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain
Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain
García F:
Servicio de Microbiología, Hospital Universitario San Cecilio, Granada, Spain
Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs.Granada, Granada, Spain
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain
Sánchez-Seco Fariñas MP:
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain
Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain
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